RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TEAD3	Q99594	435 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MED20	Q9H944	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RASSF1	Q9NS23	344 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SNTN	A6NMZ2	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ENTPD6	O75354	484 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GYPB	P06028	91 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GAA	P10253	952 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PLA2G2A	P14555	144 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	NPR2	P20594	1047 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HTR1F	P30939	366 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ASCL1	P50553	236 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CXCR4	P61073	352 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HSF2	Q03933	536 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	APOF	Q13790	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LUZP2	Q86TE4	346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	NSMAF	Q92636	917 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FOXB1	Q99853	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZG16	O60844	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MSR1	P21757	451 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FMO3	P31513	532 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PYCR1	P32322	319 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CD79B	P40259	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CDH11	P55287	796 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CSNK2B	P67870	215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MED21	Q13503	144 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GABRA6	Q16445	453 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PCK2	Q16822	640 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FAM27B	Q5VT28	67 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OTULIN	Q96BN8	352 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RERGL	Q9H628	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HCFC1	P51610	2035 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		A0A1W2PPL8	197 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		J3QKU1	62 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLDN14	O95500	239 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TF	P02787	698 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SCG5	P05408	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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