RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570801.1

NME2-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2, human

TSL 2

Gene NME2, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME2-208	ENST00000570801	POU4F3	Q15319	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SSX1	Q16384	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MNT	Q99583	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ASB6	Q9NWX5	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	XKRY	O14609	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	GLCE	O94923	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SNX4	O95219	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	IGHM	P01871	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	HLA-DPB1	P04440	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FOXO1	Q12778	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	DDO	Q99489	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MED20	Q9H944	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MED11	Q9P086	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801		A0A1W2PRG6	482 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801		A6NIZ1	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	LRRN3	E7EW58	273 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	GMFG	O60234	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FZD7	O75084	574 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	EPX	P11678	715 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SPI1	P17947	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	IDUA	P35475	653 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PTGDS	P41222	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	CRYBB2	P43320	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	RAP1B	P61224	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	RAP1A	P62834	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SHF	Q7M4L6	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	NMNAT3	Q96T66	252 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME2-208	ENST00000570801	MDFI	Q99750	246 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 251.6 ms