RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 LYZL4Q96KX0 146 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 DDOQ99489 341 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 TM2D2Q9BX73 214 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 NANOGQ9H9S0 305 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 EQTNQ9NQ60 294 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SENP1Q9P0U3 644 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 H3BUX3 64 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 UPK1AO00322 258 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 TM9SF1O15321 606 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CHST1O43916 411 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PLOD3O60568 738 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 TNFRSF6BO95407 300 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC175P0C221 793 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CD79AP11912 226 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 HPGDP15428 266 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CCT5P48643 541 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 P2RX1P51575 399 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CCR4P51679 360 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 BTG1P62324 171 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GALK2Q01415 458 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MYL5Q02045 173 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SLC3A1Q07837 685 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MERTKQ12866 999 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CUL3Q13618 768 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SLC17A1Q14916 467 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 QPRTQ15274 297 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CCNG2Q16589 344 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MMEL1Q495T6 779 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SYT14P1Q58G82 188 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 KLBQ86Z14 1044 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PNKDQ8N490 385 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GPR151Q8TDV0 419 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 NSMAFQ92636 917 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 RORBQ92753 470 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF75AQ96N20 296 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 LAT2Q9GZY6 243 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF702PQ9H963 129 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GIN1Q9NXP7 522 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 CD274Q9NZQ7 290 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF879B4DU55 563 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 P2RY10O00398 339 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 KCNK2O95069 426 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 LCKP06239 509 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PATE4P0C8F1 98 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 SERPINB1P30740 379 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ARFIP1P53367 373 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 AQP5P55064 265 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ARF6P62330 175 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PSPHP78330 225 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 H3F3AP84243 136 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 ZBED6P86452 979 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 FHL3Q13643 280 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 PDE7AQ13946 482 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 OR4D1Q15615 310 aa3.56□□□□□ -1.84
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms