RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 MSMBP08118 114 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 LINGO3P0C6S8 592 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PNMTP11086 282 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OSMP13725 252 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PRG2P13727 222 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PGCP20142 388 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 FUT4P22083 530 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 FPR3P25089 353 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 EDNRAP25101 427 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OMPP47874 163 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GSSP48637 474 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PPOXP50336 477 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 UGT2B15P54855 530 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PRPS1P60891 318 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CXCR4P61073 352 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ISL1P61371 349 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TGFBR3Q03167 851 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN31Q12999 210 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 LAPTM4AQ15012 233 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CD226Q15762 336 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF691Q5VV52 312 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 KRT80Q6KB66 452 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OR51F2Q8NH61 342 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OR5B2Q96R09 309 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CA10Q9NS85 328 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 MED29Q9NX70 200 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.06□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WUJ7 227 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GWA3 101 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZAR1LA6NP61 321 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PNPP00491 289 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CRYAAP02489 173 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 LYNP07948 512 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GNAO1P09471 354 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OR4A8P0C604 315 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GKN3PP0CG01 181 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 HKR1P10072 659 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 P2RX1P51575 399 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 MAP2K6P52564 334 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 COPZ1P61923 177 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 IL1RL1Q01638 556 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PRKCDQ05655 676 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-215ENST00000560424 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-215ENST00000560424 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF786Q8N393 782 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF614Q8N883 585 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 OR5W2Q8NH69 310 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PIGXQ8TBF5 258 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM239Q8WW34 195 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CYGBQ8WWM9 190 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 LIPHQ8WWY8 451 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF566Q969W8 418 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CNBD2Q96M20 576 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 MUS81Q96NY9 551 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 SLC6A7Q99884 636 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 PLK3Q9H4B4 646 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GPR171O14626 319 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 MPZL2O60487 215 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 TFP02787 698 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC159P0C7I6 412 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 FPR2P25090 351 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GGT2P36268 569 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-215ENST00000560424 CRISP1P54107 249 aa8.04□□□□□ -1.12
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