RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERVK-25P63136 954 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARG2P78540 354 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLGLB1Q02325 96 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF91Q05481 1191 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NADK2Q4G0N4 442 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL12Q53G59 568 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYT14P1Q58G82 188 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALG10Q5BKT4 473 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHFQ7M4L6 423 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SATL1Q86VE3 508 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 STX19Q8N4C7 294 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRACQ8N912 160 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR4K13Q8NH42 304 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 THAP4Q8WY91 577 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 GGHQ92820 318 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF566Q969W8 418 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RASD2Q96D21 266 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL5BQ96KC2 179 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRR1Q96L50 414 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGCZQ96LD1 299 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q96MT0 163 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGAP4Q96P64 663 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5B2Q96R09 309 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 COPS4Q9BT78 406 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 FN3KQ9H479 309 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 FKRPQ9H9S5 495 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 BATF3Q9NR55 127 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEPPQ9NTK1 212 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A087WZY1 265 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2M5A3KFT3 312 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR5H15A6NDH6 313 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLCA1A8K7I4 914 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 H3BUI4 141 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 H7C1C5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 IMPA2O14732 288 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEC14L5O43304 696 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFNA2O43921 213 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBR3O75828 277 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEURL1O76050 574 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKR7A3O95154 331 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNX4O95219 450 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 MT-ATP6P00846 226 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNGP01579 166 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFAP2AP05549 437 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 GYPBP06028 91 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLUP10909 449 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF3P17036 446 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNR1P21554 472 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACVR2AP27037 513 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHC1P29353 583 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 UQCRC1P31930 480 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL5P46777 297 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 NR1H2P55055 460 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDH11P55287 796 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRPS1P60891 318 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXCR4P61073 352 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCN6P62502 163 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC35A2P78381 396 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms