RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556579.5

WARS-231, Transcript of tryptophanyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene WARS, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WARS-231	ENST00000556579	CTXN1	P60606	82 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	FMOD	Q06828	376 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RIN1	Q13671	783 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SGCA	Q16586	387 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	IFI44L	Q53G44	452 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	NRM	Q8IXM6	262 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	HPS1	Q92902	700 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RBP7	Q96R05	134 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	NME4	O00746	187 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SERPINA1	P01009	418 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	IGHM	P01871	453 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	HPX	P02790	462 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	NAT2	P11245	290 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ZNF32	P17041	273 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ACHE	P22303	614 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	CCNO	P22674	350 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	CDA	P32320	146 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SLC9A3	P48764	834 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	NUDT2	P50583	147 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	UCP2	P55851	309 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	PRKCD	Q05655	676 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	TRIP10	Q15642	601 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RRM2B	Q7LG56	351 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	OAF	Q86UD1	273 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	RDH5	Q92781	318 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.34	□□□□□ -0.59
WARS-231	ENST00000556579	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579		A6NIZ1	184 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	MT-ND5	P03915	603 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	ZNF250	P15622	560 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	MAK	P20794	623 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	DRD4	P21917	467 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	STOM	P27105	288 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	IL2RG	P31785	369 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	GSK3B	P49841	420 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	RAP1B	P61224	184 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	RAP1A	P62834	184 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	MOG	Q16653	247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.33	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579		A0A087WUU8	490 aa		11.32	□□□□□ -0.6
WARS-231	ENST00000556579		A0A1W2PPL8	197 aa		11.32	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms