RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PGGHGQ32M88 737 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NRMQ8IXM6 262 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM222BQ8WU58 562 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DIABLOQ9NR28 239 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF221Q9UK13 617 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 AURKCQ9UQB9 309 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 UPK1BO75841 260 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GABARAPO95166 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGHV4-39P01824 125 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ADRA2AP08913 450 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR4A8P0C604 315 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 RAB1AP62820 205 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 BEX5Q5H9J7 111 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM201AQ5SY85 155 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 REP15Q6BDI9 236 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MDP1Q86V88 176 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NATD1Q8N6N6 113 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TESCQ96BS2 214 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NOX3Q9HBY0 568 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ING3Q9NXR8 418 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DHRS12A0PJE2 317 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SERPINA1P01009 418 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ATP6V1B2P21281 511 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CD40P25942 277 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PAX6P26367 422 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NOS3P29474 1203 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SQLEQ14534 574 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 UEVLDQ8IX04 471 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR2T12Q8NG77 320 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LRRC58Q96CX6 371 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF607Q96SK3 696 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 KCNK17Q96T54 332 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 A6NIN4 97 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 OR5H1A6NKK0 313 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 GJE1A6NN92 205 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM25AB3EWG3 89 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM25CB3EWG5 89 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM25GB3EWG6 89 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 WNT9BO14905 357 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CCNKO75909 580 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 HLA-DPB1P04440 258 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 QDPRP09417 244 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 IGFBP2P18065 325 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PTH2RP49190 550 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LIPEQ05469 1076 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SLC17A1Q14916 467 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 CTF1Q16619 201 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ODF4Q2M2E3 257 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PTOV1Q86YD1 416 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SPARTQ8N0X7 666 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 ACER3Q9NUN7 267 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-212ENST00000548567 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms