RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 E7EQL1 145 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DCTN6O00399 190 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MGRN1O60291 552 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RAB36O95755 333 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SOD3P08294 240 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NR2C1P13056 603 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CBR1P16152 277 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DNASE1P24855 282 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 LAP3P28838 519 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RAB1AP62820 205 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RAB39AQ14964 217 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SGCAQ16586 387 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PGGHGQ32M88 737 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SLC36A3Q495N2 470 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ADCK1Q86TW2 530 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF611Q8N823 705 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NINJ1Q92982 152 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FBXO17Q96EF6 278 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RBP7Q96R05 134 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NMNAT3Q96T66 252 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CCL19Q99731 98 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NUAK2Q9H093 628 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 EMC7Q9NPA0 242 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IL20Q9NYY1 176 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 AP4S1Q9Y587 144 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RTTNQ86VV8 2226 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CR1P17927 2039 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 OR6C68A6NDL8 312 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 H3BNX3 289 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ARPC3O15145 178 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SLC16A7O60669 478 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MPZL1O95297 269 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DANCRP0C864 163 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CCL2P13500 99 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF32P17041 273 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GSTM3P21266 225 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NOS3P29474 1203 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ARR3P36575 388 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ART1P52961 327 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ACTR3P61158 418 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GK3PQ14409 553 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ATP6AP1Q15904 470 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MEP1BQ16820 701 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NRN1LQ496H8 165 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 KRT80Q6KB66 452 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 VHLLQ6RSH7 139 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FNDC8Q8TC99 324 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms