RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.48	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	DCTN6	O00399	190 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	TMCC2	O75069	709 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	RAD51D	O75771	328 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	LYZL6	O75951	148 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	SEC14L2	O76054	403 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CGA	P01215	116 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	B4GALT1	P15291	398 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	GABRB1	P18505	474 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	MSR1	P21757	451 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	EDNRA	P25101	427 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	GSTT1	P30711	240 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CAPZA2	P47755	286 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	NUDT6	P53370	316 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CSNK2B	P67870	215 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM8	P78325	824 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	EFNB1	P98172	346 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY6	Q15077	328 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ETFDH	Q16134	617 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	DDO	Q99489	341 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	TEAD3	Q99594	435 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT8	Q9NY28	637 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.47	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	TVP23A	A6NH52	213 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ITGA5	P08648	1049 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A5	P22732	501 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CDA	P32320	146 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	MTNR1A	P48039	350 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	HSF2	Q03933	536 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL22	Q53GT1	634 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	RNFT2	Q96EX2	444 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	RNF121	Q9H920	327 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC42	Q9Y546	428 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		10.46	□□□□□ -0.73
DDB1-223	ENST00000543658	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.46	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.46	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HCFC1	P51610	2035 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658		A8MXE2	369 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC1A7	O00341	560 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZG16	O60844	167 aa		10.45	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74

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