RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542142.1

MMP17-208, Transcript of matrix metallopeptidase 17, human

TSL 4

Gene MMP17, Length 758 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMP17-208	ENST00000542142	CCNB2	O95067	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	TXNDC12	O95881	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SERPINA5	P05154	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SLC6A6	P31641	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CDA	P32320	146 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	LCN6	P62502	163 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	HGFAC	Q04756	655 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	GK3P	Q14409	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142		Q5PR19	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	RASD2	Q96D21	266 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CA10	Q9NS85	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	IMPA2	O14732	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CDKN1A	P38936	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ATP5J2	P56134	94 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	RAB39A	Q14964	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SGCA	Q16586	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	MICA	Q29983	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	RNF121	Q9H920	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142		U3KQV3	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	DSCAM	O60469	2012 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SOCS2	O14508	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ARPC3	O15145	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CST1	P01037	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	GAST	P01350	101 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	BMP4	P12644	408 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF35	P13682	527 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SERPINF1	P36955	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142		A0A1W2PPL8	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	IDH3B	O43837	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PTH	P01270	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CST2	P09228	141 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	OR4A8	P0C604	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CD99	P14209	185 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CTLA4	P16410	223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	MSR1	P21757	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	NR4A1	P22736	598 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	LAP3	P28838	519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PLP2	Q04941	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	DAG1	Q14118	895 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MMP17-208	ENST00000542142	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MMP17-208	ENST00000542142		H7C417	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MMP17-208	ENST00000542142	GNGT2	O14610	69 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MMP17-208	ENST00000542142	SLC16A7	O60669	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF32	P17041	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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