RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 L7N2F9 121 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 IMPA2O14732 288 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PPM1DO15297 605 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PPM1BO75688 479 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SERPINI2O75830 405 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF432O94892 652 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 MT-ND4P03905 459 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NMBP08949 121 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PPP3CBP16298 524 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CERS1P27544 350 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PYCR1P32322 319 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PTH2RP49190 550 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SELENOPP49908 381 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CCR6P51684 374 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A1P53007 311 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 TSPAN5P62079 268 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 MADCAM1Q13477 382 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FHL1Q13642 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FZD2Q14332 565 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 DUSP5Q16690 384 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 STPG2Q8N412 459 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 OR5J2Q8NH18 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NACC2Q96BF6 587 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 HAVCR1Q96D42 359 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SFXN2Q96NB2 322 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 DDOQ99489 341 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FBRSQ9HAH7 460 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 RDH8Q9NYR8 311 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.51□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CIB4A0PJX0 185 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 A6NCN8 305 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 URADA6NGE7 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 IGLON5A6NGN9 336 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GLOD5A6NK44 160 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NDUFA2O43678 99 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GMDSO60547 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CTNSO60931 367 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJB6O75190 326 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NKX2-2O95096 273 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NDUFB2O95178 105 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PCDH8O95206 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NTN1O95631 604 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CPMP14384 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 GABRA1P14867 456 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 RPA2P15927 270 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SRMP19623 302 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CXCL2P19875 107 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 NOS3P29474 1203 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 S100A11P31949 105 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 RAB8AP61006 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF273Q14593 569 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 PON3Q15166 354 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 IRF4Q15306 451 aa6.5□□□□□ -1.37
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms