RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RPL21P46778 160 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ACTR3P61158 418 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2HP62256 183 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SLC3A1Q07837 685 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GGTLC2Q14390 218 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RCN1Q15293 331 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 IL23RQ5VWK5 629 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.75□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF128Q8TEB7 428 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.75□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.75□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.75□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 SCO2O43819 266 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RDH16O75452 317 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MYO1DO94832 1006 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RCBTB2O95199 551 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CHRNGP07510 517 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 UCHL3P15374 230 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TNFRSF17Q02223 184 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RAB35Q15286 201 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.74□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ARL5AQ9Y689 179 aa3.74□□□□□ -1.81
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PDE4D-217ENST00000509355 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CSF3P09919 207 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR56A5P0C7T3 313 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CCL3P10147 92 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TBXA2RP21731 343 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GALP22466 123 aa3.73□□□□□ -1.81
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