RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MASP2O00187 686 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G10O15496 165 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SSX4O60224 188 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZIC3O60481 467 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TMCC2O75069 709 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM127O75204 238 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF432O94892 652 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 APOA1P02647 267 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ICAM2P13598 275 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LIFP15018 202 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ATF1P18846 271 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR3DL2P43630 455 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CCR9P51686 369 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDN6P56747 220 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SCN1BQ07699 218 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SELENBP1Q13228 472 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 P2RY14Q15391 338 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PYDC2Q56P42 97 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DHRS13Q6UX07 377 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 GLRX5Q86SX6 157 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF128Q8TEB7 428 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 THEM6Q8WUY1 208 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RELTQ969Z4 430 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C4orf45Q96LM5 186 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CMTM3Q96MX0 182 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PISDQ9UG56 409 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SPEGQ15772 3267 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MPZL1O95297 269 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-CO3P00414 261 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 HRGP04196 525 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SRMP19623 302 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TCN2P20062 427 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEB1P43366 347 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2B6P58173 313 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MEP1BQ16820 701 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 Q499Y3 187 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SYT9Q86SS6 491 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 NSMAFQ92636 917 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MIB2Q96AX9 1013 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SGCZQ96LD1 299 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf34Q96MH7 638 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ABHD6Q9BV23 337 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP13Q12802 2813 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PNR3 127 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ACOD1A6NK06 481 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 AQP7P3A6NL99 342 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM212A6NML5 194 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM25AB3EWG3 89 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM25CB3EWG5 89 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM25GB3EWG6 89 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PDCD5O14737 125 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF254O75437 659 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms