RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCD4O14678 606 aa12.69□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 CST2P09228 141 aa12.69□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 SKA3Q8IX90 412 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10H5Q8NGA6 315 aa12.68□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 GIPRP48546 466 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.67□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 SEC14L2O76054 403 aa12.66□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 CECR9P0C854 216 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF823P16415 610 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKACGP22612 351 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 APLNRP35414 380 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A1P53007 311 aa12.66□□□□□ -0.38
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SH3BP2-208ENST00000504294 FMODQ06828 376 aa12.66□□□□□ -0.38
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