RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 XKRXQ6PP77 449 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MARCH3Q86UD3 253 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD46Q86W74 232 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF614Q8N883 585 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ASB5Q8WWX0 329 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FCGR1BQ92637 280 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 RND1Q92730 232 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CDS1Q92903 461 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MYDGFQ969H8 173 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GIMAP5Q96F15 307 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 C16orf58Q96GQ5 468 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 LYZL4Q96KX0 146 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 KLHL15Q96M94 604 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CMTM3Q96MX0 182 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SFXN2Q96NB2 322 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DACH2Q96NX9 599 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR7D2Q96RA2 312 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF347Q96SE7 839 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PIGQQ9BRB3 760 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DGCR6LQ9BY27 220 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DSN1Q9H410 356 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TINAGQ9UJW2 476 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MEMO1Q9Y316 297 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SH3GLB1Q9Y371 365 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 BSNQ9UPA5 3926 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 A0A087WZY1 265 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PPW3 197 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PQD3 144 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 A6NNC1 897 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HSPB2A8KAH6 182 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 C5orf58C9J3I9 102 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CLDN25C9JDP6 229 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD28O15084 1053 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HCRTR2O43614 444 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 GMFGO60234 142 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FADS1O60427 444 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ZG16O60844 167 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NDUFB8O95169 186 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR2C1O95371 312 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CLDN14O95500 239 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 APOA1P02647 267 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 NGFRP08138 427 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 OR12D1P0DN82 309 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 AGAP20933 346 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CRHBPP24387 322 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ELK4P28324 431 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 IL12AP29459 219 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 RYKP34925 604 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DCTP40126 519 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 CRATP43155 626 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 MAGEA8P43361 318 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ENTPD1P49961 510 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 ATP12AP54707 1039 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DEFA1P59665 94 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 DEFA3P59666 94 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 SRYQ05066 204 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 PMPCAQ10713 525 aa4.01□□□□□ -1.77
RBM39-240ENST00000495293 HSPB2Q16082 182 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms