RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494549.1

ACTR1A-206, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR1A, Length 520 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1A-206ENST00000494549 SSR3Q9UNL2 185 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ZANQ9Y493 2812 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 A0A1W2PPR1 153 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 A8MVM7 634 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SULT2B1O00204 365 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CTAG2O75638 210 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SYNGR4O95473 234 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 IL1AP01583 271 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OPN1SWP03999 348 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 THBDP07204 575 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 HSMCR30P0CW71 290 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OSMP13725 252 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 COX6B1P14854 86 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CD79BP40259 229 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OR3A2P47893 321 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 NUDT6P53370 316 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ASAH1Q13510 395 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 GPR50Q13585 617 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC17A1Q14916 467 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CDK10Q15131 360 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MED22Q15528 200 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OR1Q1Q15612 314 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OCLNQ16625 522 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF613Q6PF04 617 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ULK3Q6PHR2 472 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 LINC00471Q8N535 108 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 OR6S1Q8NH40 331 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM222BQ8WU58 562 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TAAR8Q969N4 342 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TMEM80Q96HE8 168 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 BOD1Q96IK1 185 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF559Q9BR84 538 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TIGARQ9NQ88 270 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CMAHPQ9Y471 501 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 USF3Q68DE3 2245 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 NF1P21359 2839 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 AQP7P3A6NL99 342 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 M0R3H8 397 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 GPX5O75715 221 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF432O94892 652 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 BGLAPP02818 100 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 IFNW1P05000 195 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 TSPAN19P0C672 248 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 EPXP11678 715 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 COX5AP20674 150 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CXCR1P25024 350 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SSTR2P30874 369 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 NR4A2P43354 598 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SIRPAP78324 504 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC35A1P78382 337 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 POU4F3Q15319 338 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SPHARQ15513 63 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTR1A-206ENST00000494549 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms