RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CMIPQ8IY22 773 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OSTF1Q92882 214 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ORAI1Q96D31 301 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EPYCQ99645 322 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MED17Q9NVC6 651 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IMPA2O14732 288 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPA12AO43301 675 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SC5DO75845 299 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IL1AP01583 271 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 UMODP07911 640 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NID1P14543 1247 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AGAP20933 346 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FPR1P21462 350 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP11P24347 488 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BMI1P35226 326 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PMELP40967 661 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM11AP58511 58 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC26A5P58743 744 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NHLH1Q02575 133 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DYRK1AQ13627 763 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PCOLCEQ15113 449 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAM1Q15629 374 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EXT1Q16394 746 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CASP12Q6UXS9 341 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF605Q86T29 641 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BCORP1Q8N888 145 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT14Q8NB59 555 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 STOML3Q8TAV4 291 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CT55Q8WUE5 264 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TM9SF4Q92544 642 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR87Q9BY21 358 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGMQ9H3S5 423 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 REEP1Q9H902 201 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BCO1Q9HAY6 547 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KCND3Q9UK17 655 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NINQ8N4C6 2090 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PLSCR5A0PG75 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CLCA1A8K7I4 914 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 G3V3Q6 166 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AP4M1O00189 453 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR31O00270 319 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DLEU1O43261 78 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FCMRO60667 390 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RGS11O94810 467 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF15O95150 251 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NGFRP08138 427 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8U8P0C7N1 319 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRA1P14867 456 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A11P31949 105 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 STAT5AP42229 794 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN6P56747 220 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LAPTM4AQ15012 233 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HACD4Q5VWC8 232 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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