RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CD3E	P07766	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CD14	P08571	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IFI30	P13284	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ACADS	P16219	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ITGA2	P17301	1181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TTK	P33981	857 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARR3	P36575	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ART1	P52961	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BID	P55957	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NAAA	Q02083	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HGFAC	Q04756	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FOXB1	Q99853	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PRG6	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		H7C1C5	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		H7C417	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DCTN6	O00399	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GSTA4	O15217	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RNF13	O43567	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KRT36	O76013	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LY6H	O94772	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SNAP29	O95721	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BCL10	O95999	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IGHG1	P01857	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CECR9	P0C854	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AHCY	P23526	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FPR3	P25089	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IFNA8	P32881	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GPR4	P46093	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PTH2R	P49190	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	EVX1	P49640	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ERF	P50548	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMIM11A	P58511	58 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LCN6	P62502	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KEAP1	Q14145	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GK3P	Q14409	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	EFNB3	Q15768	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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