RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MED13LQ71F56 2210 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTB-211ENST00000480301 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC12O95881 172 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF35P13682 527 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CD99P14209 185 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 NPR2P20594 1047 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SDHAP31040 664 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 MST1LQ2TV78 715 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 GPR139Q6DWJ6 353 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 OR2T5Q6IEZ7 315 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 LRRC18Q8N456 261 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 OR9Q2Q8NGE9 314 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 OR2T29Q8NH02 315 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 RASD2Q96D21 266 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 OR52D1Q9H346 318 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 VPS13CQ709C8 3753 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 PRSS37A4D1T9 235 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 XKRYO14609 159 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 AHCYL1O43865 530 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS7O75251 213 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA5P05154 406 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN31Q12999 210 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SGCAQ16586 387 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC36A2Q495M3 483 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 LINC00471Q8N535 108 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FANK1Q8TC84 345 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CHID1Q9BWS9 393 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CACNG6Q9BXT2 260 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 RNF121Q9H920 327 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 DLL4Q9NR61 685 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 POMPQ9Y244 141 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ACANP16112 2415 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 IMPA2O14732 288 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CCNB2O95067 398 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 GASTP01350 101 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 APEHP13798 732 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 NR4A1P22736 598 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KA3P51812 740 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FLOT2Q14254 428 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ADIPOQQ15848 244 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ETFDHQ16134 617 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FAM27BQ5VT28 67 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 VHLLQ6RSH7 139 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 PTCHD4Q6ZW05 846 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 Q96MF0 132 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 REEP1Q9H902 201 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 DHRS12A0PJE2 317 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SOCS2O14508 198 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ATP5HO75947 161 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3DO95685 299 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-39P01824 125 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SCG5P05408 212 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 OR4A8P0C604 315 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CTLA4P16410 223 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A6P31641 620 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 THBS4P35443 961 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SERPINF1P36955 418 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 DAG1Q14118 895 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 MICAQ29983 383 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 KRT80Q6KB66 452 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 FBXO17Q96EF6 278 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SAMD8Q96LT4 415 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 KCNN2Q9H2S1 579 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 U3KQV3 271 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPL8 197 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ARPC3O15145 178 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 LAP3P28838 519 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ADCK1Q86TW2 530 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SPATA24Q86W54 205 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 IFT27Q9BW83 186 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SYT4Q9H2B2 425 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 POLE4Q9NR33 117 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 H7C417 338 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CST1P01037 141 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 CST2P09228 141 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF32P17041 273 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 RASSF2P50749 326 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
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