RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 THTPAQ9BU02 230 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RNF121Q9H920 327 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 AQP12BA6NM10 295 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 IDH3BO43837 385 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 DIRAS1O95057 198 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RAP2AP10114 183 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ATP6V1B2P21281 511 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 FUT4P22083 530 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 NR4A1P22736 598 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SLC6A6P31641 620 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 EVX1P49640 407 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 MYBPC1Q00872 1141 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 DAG1Q14118 895 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SEC23BQ15437 767 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 FAM122BQ7Z309 247 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 BIVMQ86UB2 503 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 YY1AP1Q9H869 796 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PRSS37A4D1T9 235 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF11BO00300 401 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ARPC3O15145 178 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 UBOX5O94941 541 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SNAP29O95721 258 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TXNDC12O95881 172 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CST2P09228 141 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CSF3P09919 207 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ZNF35P13682 527 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CALCRP30988 508 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GLRXP35754 106 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CDKN1AP38936 164 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RAD52P43351 418 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ERVK-25P63136 954 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 MS4A2Q01362 244 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TSPAN31Q12999 210 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RFX4Q33E94 735 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 Q96MF0 132 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SNX18Q96RF0 628 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SH3GL3Q99963 347 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 REEP1Q9H902 201 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 NOX3Q9HBY0 568 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CMAHPQ9Y471 501 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 USF3Q68DE3 2245 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ACOT8O14734 319 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SLC2A10O95528 541 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CELA3BP08861 270 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 INHBBP09529 407 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 OR4A8P0C604 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GSTM3P21266 225 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 MSR1P21757 451 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PCSK6P29122 969 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 NOS3P29474 1203 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CRABP1P29762 137 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 APLNRP35414 380 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 GSSP48637 474 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 PPOXP50336 477 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 EFNA4P52798 201 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SELENOVP59797 346 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 HSF2Q03933 536 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 HGFACQ04756 655 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 RAB39AQ14964 217 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 ADIPOQQ15848 244 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SGCAQ16586 387 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 LRRC18Q8N456 261 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 OR2T29Q8NH02 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 FANK1Q8TC84 345 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 NSMAFQ92636 917 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-211ENST00000476336 FBXO17Q96EF6 278 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms