RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 IER3P46695 156 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 EFNB2P52799 333 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL8P80075 99 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF8Q02556 426 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC3A1Q07837 685 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXF1Q12946 379 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LCP2Q13094 533 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PDK3Q15120 406 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DECR1Q16698 335 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TTMPQ5BVD1 217 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT80Q6KB66 452 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MED27Q6P2C8 311 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP12Q6UXS9 341 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPH1Q70E73 1250 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 COMTD1Q86VU5 262 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT13Q86X67 352 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR34Q96EX3 536 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 KIFC1Q9BW19 673 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NOX3Q9HBY0 568 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TNCP24821 2201 aa3.31□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 UTS2O95399 124 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PTMAP06454 111 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 QDPRP09417 244 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LINGO3P0C6S8 592 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IL7RP16871 459 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 UQCRC2P22695 453 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MYF6P23409 242 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC1A2P43004 574 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MARCKSL1P49006 195 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PGGT1BP53609 377 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GPX6P59796 221 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GNB2P62879 340 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PHEXP78562 749 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CDKL1Q00532 357 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NPRL3Q12980 569 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SELENBP1Q13228 472 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CHIT1Q13231 466 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SCARB2Q14108 478 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LTB4RQ15722 352 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PDK4Q16654 411 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP78Q5JTW2 689 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SPICQ8N5J4 248 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OR7G3Q8NG95 312 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PIGXQ8TBF5 258 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF675Q8TD23 568 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL17Q92583 94 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM18Q96B42 140 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINB12Q96P63 405 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5B2Q96R09 309 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM15Q9C019 465 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HRH4Q9H3N8 390 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CRLF2Q9HC73 371 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms