RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 C1orf61Q13536 156 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 BRICD5Q6PL45 260 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 LMX1AQ8TE12 382 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ADOQ96SZ5 270 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR10A2Q9H208 303 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ARV1Q9H2C2 271 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MCRIP1C9JLW8 97 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 HMGN4O00479 90 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MAN2B1O00754 1011 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 GLCEO94923 617 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ADH1BP00325 375 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OPN1LWP04000 364 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MVDP53602 400 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 IHHQ14623 411 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TUSC1Q2TAM9 212 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 C2orf76Q3KRA6 126 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SPRYD7Q5W111 196 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR2A2Q6IF42 318 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 LYG2Q86SG7 212 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 LGI3Q8N145 548 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TANKQ92844 425 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 IGSF21Q96ID5 467 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 Q96M85 177 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MMP26Q9NRE1 261 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ADAM29Q9UKF5 820 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 Q9Y3F1 56 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 V9GYS6 101 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NINQ8N4C6 2090 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPQ1 181 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 LRP5LA4QPB2 252 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 C17orf105B2RV13 164 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 AP4M1O00189 453 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 HOXB2P14652 356 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NTF3P20783 257 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 AVPR2P30518 371 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SLC7A9P82251 487 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 GUCA2AQ02747 115 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NSDHLQ15738 373 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ZNF528Q3MIS6 628 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TMEM65Q6PI78 240 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR5L1Q8NGL2 311 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR10A5Q9H207 317 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ABI3Q9P2A4 366 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TP53I11O14683 189 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CTSLP07711 333 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SPP1P10451 314 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 KITLGP21583 273 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 RNLSQ5VYX0 342 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SMIM19Q96E16 107 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SGPP1Q9BX95 441 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 METTL9Q9H1A3 318 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 BANF2Q9H503 90 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CBLCQ9ULV8 474 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MED16Q9Y2X0 877 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SUSD5O60279 629 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CLDN1O95832 211 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 HBQ1P09105 142 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 FBLP22087 321 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ITGB8P26012 769 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ERVK-16P61578 105 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 PLGLB1Q02325 96 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 GPNMBQ14956 572 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 CDK5R1Q15078 307 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 FAM69BQ5VUD6 431 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 AADACL3Q5VUY0 350 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 TMEM151BQ8IW70 566 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 MS4A8Q9BY19 250 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 WWTR1Q9GZV5 400 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A19Q9HC21 320 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms