RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 NAT1P18440 290 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 ACHEP22303 614 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 C1orf61Q13536 156 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 NR0B2Q15466 257 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 FAM166AQ6J272 317 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 MDGA2Q7Z553 956 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 OTOSQ8NHW6 89 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.97■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 C11orf98E9PRG8 122 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 SLC17A2O00624 439 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 DOK2O60496 412 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 SDC3O75056 442 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 ALOX12BO75342 701 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 RPA2P15927 270 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 CFPP27918 469 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 C17orf107Q6ZR85 190 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 KRT77Q7Z794 578 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 TMED4Q7Z7H5 227 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 OOSP2Q86WS3 158 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 OR6K3Q8NGY3 331 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 C1orf198Q9H425 327 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 AQP8O94778 261 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 MPPED2Q15777 294 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 PRR22Q8IZ63 422 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 SLC25A28Q96A46 364 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 SEH1LQ96EE3 360 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 OR8B4Q96RC9 309 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 LDAHQ9H6V9 325 aa16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CITED2-201ENST00000367651 RFPL4AA6NLU0 287 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 D6RAR5 112 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TOR1AO14656 332 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 RENP00797 406 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 OR4E1P0C645 316 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ETFDHQ16134 617 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 H3BUI4 141 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ZNF264O43296 627 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 SNAPC5O75971 98 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 UTS2O95399 124 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 HPGDP15428 266 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TPMTP51580 245 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 SLC17A1Q14916 467 aa16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 PCNX3Q9H6A9 2034 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TSPAN9O75954 239 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 HLA-DQA2P01906 255 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 CENPAP49450 140 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 HHEXQ03014 270 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 EMC4Q5J8M3 183 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ZNF563Q8TA94 476 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TAS2R4Q9NYW5 299 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TMEM82A0PJX8 343 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 LIPCP11150 499 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 GMFBP60983 142 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TMEM225Q6GV28 225 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ZNF627Q7L945 461 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 ST8SIA2Q92186 375 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.94■□□□□ 0.3
CITED2-201ENST00000367651 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms