RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 PEX14O75381 377 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 MTFR2Q6P444 385 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 TMEM205Q6UW68 189 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 ST8SIA1Q92185 356 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 MRI1Q9BV20 369 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 KCNG2Q9UJ96 466 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 FKBP7Q9Y680 259 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.33■□□□□ 0.85
LDB1-201ENST00000361198 RAF1P04049 648 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SYPP08247 313 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 CCR9P51686 369 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 MELKQ14680 651 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 HES5Q5TA89 166 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 BEST4Q8NFU0 473 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR8K3Q8NH51 312 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 V9GY05 133 aa20.33■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 YKT6O15498 198 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SULT1B1O43704 296 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SLC16A7O60669 478 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 HLA-DQA2P01906 255 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 HLA-DOBP13765 273 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ETFDHQ16134 617 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ESCO2Q56NI9 601 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LINGO2Q7L985 606 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZNF680Q8NEM1 530 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OTOSQ8NHW6 89 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 MNTQ99583 582 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 DLL4Q9NR61 685 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 MYOTQ9UBF9 498 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 FREM3P0C091 2139 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 GMDSO60547 372 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 TSC22D2O75157 780 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SLC22A5O76082 557 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 NAGAP17050 411 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 CENPAP49450 140 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 EGR3Q06889 387 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 RNF138Q8WVD3 245 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.32■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LEUTXA8MZ59 168 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR2J2O76002 312 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZFAND5O76080 213 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 TGM6O95932 706 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 HPXP02790 462 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 FGF5P12034 268 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 CTLA4P16410 223 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZNF28P17035 718 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZXDAP98168 799 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 FCRLAQ7L513 359 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR52I2Q8NH67 350 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 RCE1Q9Y256 329 aa20.31■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 PRAF2O60831 178 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 IGHMP01871 453 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 CALCBP10092 127 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 PTH2RP49190 550 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 AP3S2P59780 193 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZP1P60852 638 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 NSMAFQ92636 917 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 NXPE2Q96DL1 559 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 RADILQ96JH8 1075 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LINC00862A6NCI5 91 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 FOXF1Q12946 379 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR7A5Q15622 319 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 Q499Y3 187 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.3■□□□□ 0.84
LDB1-201ENST00000361198 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms