RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360779.3

SDCBP2-202, Transcript of syndecan binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2, Length 1,519 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-202ENST00000360779 TM9SF2Q99805 663 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ALG8Q9BVK2 526 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 WDR76Q9H967 626 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 GLRX2Q9NS18 164 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.71□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 CCDC160A6NGH7 325 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 DHHO43323 396 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TMCC2O75069 709 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 UPK3AO75631 287 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 MPZL1O95297 269 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 IGHA1P01876 353 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TFP02787 698 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 PCMT1P22061 227 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 AGTR1P30556 359 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 PTGER4P35408 488 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ENTPD1P49961 510 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 HSF2Q03933 536 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 IRF3Q14653 427 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SATL1Q86VE3 508 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TIGD4Q8IY51 512 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SNX33Q8WV41 574 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 CRLF2Q9HC73 371 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.7□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 INMTO95050 263 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 CDAP32320 146 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 NTF4P34130 210 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 HIST3H3Q16695 136 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 XAF1Q6GPH4 301 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 MUL1Q969V5 352 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 MNTQ99583 582 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 GP6Q9HCN6 339 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.69□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 MGAQ8IWI9 3026 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TMEM129A0AVI4 362 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 J3QLW9 94 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 J3QRE1 110 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 PHYHO14832 338 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 LIMS3P0CW19 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 LIMS4P0CW20 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF19P17023 458 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 PEX19P40855 299 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 WNT4P56705 351 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ACTA2P62736 377 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ACTG2P63267 376 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF85Q03923 595 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 GALEQ14376 348 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 RAB39AQ14964 217 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ST3GAL2Q16842 350 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TIGD6Q17RP2 521 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 C10orf128Q5T292 105 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 RNLSQ5VYX0 342 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 OR5M11Q96RB7 305 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 JAM3Q9BX67 310 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 EMC7Q9NPA0 242 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 COPS3Q9UNS2 423 aa14.68□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 DPPA5A6NC42 116 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 CD8B2A6NJW9 211 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 IL2RAP01589 272 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 GAAP10253 952 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 EDN3P14138 238 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 ALDH3B2P48448 385 aa14.67□□□□□ -0.06
SDCBP2-202ENST00000360779 SPHARQ15513 63 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms