RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 ARV1Q9H2C2 271 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-202ENST00000356435 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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PTPRD-202ENST00000356435 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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