RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 GLO1Q04760 184 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 FJX1Q86VR8 437 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SYT14Q8NB59 555 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 YIPF6Q96EC8 236 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 DOK1Q99704 481 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 EMC6Q9BV81 110 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ALG8Q9BVK2 526 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 FUNDC2Q9BWH2 189 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 RERGLQ9H628 205 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 EXO5Q9H790 373 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 MARCH7Q9H992 704 aa18.51■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZG16O60844 167 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 PGA4P0DJD7 388 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 PGA3P0DJD8 388 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CTLA4P16410 223 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 KLK2P20151 261 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CLDN17P56750 224 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CLRN1P58418 232 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ISOC1Q96CN7 298 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 YIPF3Q9GZM5 350 aa18.5■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 PCNX1Q96RV3 2341 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CCRL2O00421 344 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CYTIPO60759 359 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 WISP2O76076 250 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TFP02787 698 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CD36P16671 472 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ACTA2P62736 377 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ACTG2P63267 376 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ACSM1Q08AH1 577 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 FCRLAQ7L513 359 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TIGD4Q8IY51 512 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF511Q8NB15 262 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF485Q8NCK3 441 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 GTF3C1Q12789 2109 aa18.49■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SELENOFO60613 162 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SYNGR4O95473 234 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CPN1P15169 458 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 LIPAP38571 399 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 RGS6P49758 472 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 BDH1Q02338 343 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CAMK2DQ13557 499 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 OR2G6Q5TZ20 316 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 OPALINQ96PE5 141 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 INTS14Q96SY0 518 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TBX5Q99593 518 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa18.48■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF716A6NP11 495 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 HLA-DQA2P01906 255 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 MT-ND5P03915 603 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TGFBR2P37173 567 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SRYQ05066 204 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 GATAD2BQ8WXI9 593 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TIMP4Q99727 224 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 RCE1Q9Y256 329 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJC13O75165 2243 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 PHYHO14832 338 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 GABARAPO95166 117 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CA7P43166 264 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF85Q03923 595 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 HIST3H3Q16695 136 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SYS1Q8N2H4 156 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 WDR76Q9H967 626 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 KLHL9Q9P2J3 617 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.47■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1B0GVC2 190 aa18.46■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 GPR171O14626 319 aa18.46■□□□□ 0.55
DUSP28-201ENST00000343217 HRGP04196 525 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms