RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 LINC00471Q8N535 108 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 ZNF75AQ96N20 296 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 OR52D1Q9H346 318 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SIAEQ9HAT2 523 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CA10Q9NS85 328 aa21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 DHRS12A0PJE2 317 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SOCS2O14508 198 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 GSC2O15499 205 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 PPP1R3DO95685 299 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SLC6A6P31641 620 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 GSSP48637 474 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 HGFACQ04756 655 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 TSPAN31Q12999 210 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SPATA24Q86W54 205 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 FBXO17Q96EF6 278 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CHID1Q9BWS9 393 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CACNG6Q9BXT2 260 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 U3KQV3 271 aa21.79■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 PRSS37A4D1T9 235 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 MGRN1O60291 552 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 ATP5HO75947 161 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 DAG1Q14118 895 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 RFX4Q33E94 735 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 C11orf71Q6IPW1 123 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 KRT80Q6KB66 452 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 NUP37Q8NFH4 326 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 NABP1Q96AH0 204 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SAMD8Q96LT4 415 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 IFT27Q9BW83 186 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 RERGLQ9H628 205 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 VNN3Q9NY84 501 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 POMPQ9Y244 141 aa21.78■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 AHCYL1O43865 530 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SERPINA5P05154 406 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 BMP4P12644 408 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 GALK2Q01415 458 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 HSF2Q03933 536 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 PLP2Q04941 152 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 Q96MF0 132 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 TMUB1Q9BVT8 246 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.77■■□□□ 1.08
PDF-201ENST00000288022 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 VSTM5A8MXK1 200 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 GNGT2O14610 69 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 CST1P01037 141 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 OR4A8P0C604 315 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 THBS4P35443 961 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SERPINF1P36955 418 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ADCK1Q86TW2 530 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SYT4Q9H2B2 425 aa21.76■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 PTHP01270 115 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 GASTP01350 101 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF35P13682 527 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 LAP3P28838 519 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 NOS3P29474 1203 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ERFP50548 548 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ADIPOQQ15848 244 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ETFDHQ16134 617 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 FAM27BQ5VT28 67 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.75■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SLC16A7O60669 478 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 NDUFS7O75251 213 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 TXNDC12O95881 172 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 APEHP13798 732 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 CTLA4P16410 223 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF32P17041 273 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 MSR1P21757 451 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 NR4A1P22736 598 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 MICAQ29983 383 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 FOXN4Q96NZ1 517 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 C1orf198Q9H425 327 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 CDH20Q9HBT6 801 aa21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDF-201ENST00000288022 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms