RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LIPHQ8WWY8 451 aa19.39■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 S100A7P31151 101 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SSX2Q16385 188 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BATFQ16520 125 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TCTN3Q6NUS6 607 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TMUB2Q71RG4 321 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 GDPD3Q7L5L3 318 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KIRREL1Q96J84 757 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RNF167Q9H6Y7 350 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ASB16Q96NS5 453 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OLFM2O95897 454 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CD22P20273 847 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TGM4P49221 684 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ADPRHP54922 357 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB2A2Q13296 93 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NANPQ8TBE9 248 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NPY4RP50391 375 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RRADP55042 308 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 IKZF5Q9H5V7 419 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM30AQ9NV96 361 aa19.38■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MAST2Q6P0Q8 1798 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN1O95832 211 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RAB4AP20338 218 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PGFP49763 221 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 AVPI1Q5T686 147 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PIGTQ969N2 578 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SBK3P0C264 359 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SDHAP31040 664 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SLC19A1P41440 591 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TPMTP51580 245 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HNF4GQ14541 408 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 EXT1Q16394 746 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR52I2Q8NH67 350 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF416Q9BWM5 594 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PIGMQ9H3S5 423 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 POFUT1Q9H488 388 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DDOQ99489 341 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4CQ9C0C4 833 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 B3GAT1Q9P2W7 334 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF749O43361 778 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DFFBO76075 338 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SIX6O95475 246 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SPI1P17947 270 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NKAIN2Q5VXU1 208 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71CQ8NEG0 241 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NGBQ9NPG2 151 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA9Q9UGM1 479 aa19.37■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PRPH2P23942 346 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CLINT1Q14677 625 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BCO1Q9HAY6 547 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NTNG1Q9Y2I2 539 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CHST2Q9Y4C5 530 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP5O95183 116 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF5Q969M3 257 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR11A1Q9GZK7 315 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MOB1AQ9H8S9 216 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SMCO4Q9NRQ5 59 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KCNIP2Q9NS61 270 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PIGLQ9Y2B2 252 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 M0R082 166 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF92Q03936 586 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM81Q6P7N7 255 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SEH1LQ96EE3 360 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NRSN2Q9GZP1 204 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PADI1Q9ULC6 663 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB6O14558 160 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NXPH2O95156 264 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CDC20Q12834 499 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PTOV1Q86YD1 416 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CALHM2Q9HA72 323 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 G3V3Y1 287 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ARRB2P32121 409 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR6Q6TCH4 344 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR51A2Q8NGJ7 313 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR10R2Q8NGX6 335 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A16Q8NH70 328 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms