RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sp100O35892 482 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dok2O70469 412 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SparcP07214 302 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Il1r1P13504 576 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hsd3b3P26150 373 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gsx2P31316 305 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hrh3P58406 445 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Msto1Q2YDW2 556 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plpp5Q3UMZ3 260 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 1700057G04RikQ3V0U0 232 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spryd4Q91WK1 207 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ndufb7Q9CR61 137 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ankrd22Q9D3J5 191 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 EurlQ9D7G4 290 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmed7D3YZZ5 224 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm21560D3Z7A4 205 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1410E9PYK6 323 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4930555G01RikL7N253 205 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 P01809 118 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd1d1P11609 336 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd1d2P11610 336 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arf3P61205 181 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sat2Q6P8J2 170 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prkd2Q8BZ03 875 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TifabQ8JZM6 147 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc39a8Q91W10 462 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dyrk3Q922Y0 586 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc35a4Q9D321 324 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Isyna1Q9JHU9 557 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm21488A0A087WR99 222 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp820E9Q5G8 549 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CatsperdE9Q9F6 805 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4930451I11RikE9Q9R3 111 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn2r29L7N2D4 852 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hcrtr2P58308 460 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SlbpP97440 275 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Clns1aQ61189 236 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Azgp1Q64726 307 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lkaaear1Q8BIG2 198 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TigarQ8BZA9 269 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Csnka2ipQ8CH19 720 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pot1Q91WC1 640 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 GpnmbQ99P91 574 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tssk4Q9D411 328 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bex3Q9WTZ9 124 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atg2aQ6P4T0 1914 aa11.5□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Actl10A2AKE7 346 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fbxw24E9PXM9 466 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4933408B17RikG3X9B4 273 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sp3O70494 783 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mmp2P33434 662 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PnmtP40935 295 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wnt11P48615 354 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gng8P63078 70 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ufd1P70362 307 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mfsd12Q3U481 476 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Klk14Q8CGR5 250 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tomm34Q9CYG7 309 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lpcat2bQ9D5U0 516 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ReckQ9Z0J1 971 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Skint10A7TZG1 354 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Calhm1D3Z291 348 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm3685J3QPP2 205 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rhox4fQ2MDF8 205 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rhox4cQ2MDG1 205 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gpr55Q3UJF0 327 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem222Q8BVA2 208 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plcz1Q8K4D7 647 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mic13Q8R404 119 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1143Q8VEU8 314 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Eif2b1Q99LC8 305 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 D10Wsu102eQ9CX66 185 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rhox4aQ9D3I8 205 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam219aQ9D772 157 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr937Q9EQB4 311 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 March7Q9WV66 693 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm28710A0A1B0GR31 962 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn2r89O35199 507 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prph2P15499 346 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cpne2P59108 548 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fut10Q5F2L2 481 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fzd7Q61090 572 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Man1c1Q6NXK9 625 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Frg2f1Q6P3A2 227 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 IfnkQ7TSL0 199 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn1r210Q8R274 306 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atg5Q99J83 275 aa11.49□□□□□ -0.57
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gimap3Q99MI6 301 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms