RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLC2A10	O95528	541 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PNP	P00491	289 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	EGR1	P18146	543 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MAK	P20794	623 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	DRD4	P21917	467 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZP4	Q12836	540 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CCL17	Q92583	94 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NSMAF	Q92636	917 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLC6A7	Q99884	636 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TGDS	O95455	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF250	P15622	560 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	FUT1	P19526	365 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CD247	P20963	164 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	APLNR	P35414	380 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MPV17	P39210	176 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	AQP2	P41181	271 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CRYBB2	P43320	205 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF84	P51523	738 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	LCN2	P80188	198 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	HSF2	Q03933	536 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PLP2	Q04941	152 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SGCA	Q16586	387 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SPRN	Q5BIV9	151 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ANK2	Q01484	3957 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ISPD	A4D126	451 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	FMO6P	O60774	539 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	IGHG1	P01857	330 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ANPEP	P15144	967 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ACADS	P16219	412 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF81	P51508	661 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	FMOD	Q06828	376 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NFYC	Q13952	458 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CGREF1	Q99674	301 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PRG6	482 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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