RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 APOL4Q9BPW4 351 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.51□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 MED20Q9H944 212 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 GPR35Q9HC97 309 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 ASB6Q9NWX5 421 aa7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.5□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZT83 130 aa7.5□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.49□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 ETFDHQ16134 617 aa7.49□□□□□ -1.21
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SGMS1-211ENST00000626236 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 OR6V1Q8N148 313 aa7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 SETD9Q8NE22 299 aa7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.49□□□□□ -1.21
SGMS1-211ENST00000626236 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.49□□□□□ -1.21
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