RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.93	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A087WUU8	490 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825		A6NIZ1	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SERPINA5	P05154	406 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	RHCE	P18577	417 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAK	P20794	623 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PCSK6	P29122	969 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPOX	P50336	477 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PDLIM4	P50479	330 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAP1B	P61224	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAP1A	P62834	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	CARTPT	Q16568	116 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	NSMAF	Q92636	917 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.92	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC2A10	O95528	541 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF35	P13682	527 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	GLRX	P35754	106 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	GPR4	P46093	362 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSF2	Q03933	536 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SGCA	Q16586	387 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825		V9GYQ6	96 aa		13.91	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	XKRY	O14609	159 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	LY6H	O94772	140 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRSS23	O95084	383 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHM	P01871	453 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSD17B1	P14061	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	APLNR	P35414	380 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMIM11A	P58511	58 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	SELENOV	P59797	346 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	DGCR6	Q14129	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PYURF	Q96I23	114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	HIVEP2	P31629	2446 aa		13.9	□□□□□ -0.18
EFTUD2-215	ENST00000589825	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NDUFS8	O00217	210 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FUT4	P22083	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDA	P32320	146 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	EVX1	P49640	407 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms