RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC43A1O75387 559 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC14L2O76054 403 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 HRGP04196 525 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGS2P35354 604 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPZA2P47755 286 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 GALEQ14376 348 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 AAED1Q7RTV5 226 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 EGFL6Q8IUX8 553 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35F2Q8IXU6 374 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL36Q8N4N3 616 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13F1Q8NGS4 319 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6N1Q8NGY5 312 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS14Q96SY0 518 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC2DQ9UHP7 191 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 LCKP06239 509 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 SPHARQ15513 63 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF511Q8NB15 262 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 MCHR2Q969V1 340 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 CARD17Q5XLA6 110 aa27.52■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 LHFPL3Q86UP9 236 aa27.52■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK7Q96N67 2140 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD8Q9HCK8 2581 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOFO60613 162 aa27.51■■■□□ 2
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CAPNS1-206ENST00000588815 ACTG2P63267 376 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 TEX19Q8NA77 164 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A10Q8NG04 563 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 WDR76Q9H967 626 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa27.5■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 TEX30Q5JUR7 227 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa27.5■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF823P16415 610 aa27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 ACSM1Q08AH1 577 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
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