RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	NGFR	P08138	427 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CSF3	P09919	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF19	P17023	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB3B	P20337	219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	S1PR1	P21453	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC2A5	P22732	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR2A	P28223	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPZB	P47756	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXC5	Q00444	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PSG6	Q00889	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	E2F1	Q01094	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TDG	Q13569	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FHL1	Q13642	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF79	Q15937	498 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NRTN	Q99748	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		B4DXG7	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BML4	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	AP4M1	O00189	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SOCS6	O14544	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	T	O15178	435 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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