RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAIAP2Q9UQB8 552 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA4P78363 2273 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PR80 420 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM221AA4D161 298 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSMP13725 252 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4GALT1P15291 398 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTCHD4Q6ZW05 846 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC36Q8IYA8 594 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 LNX2Q8N448 690 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM38BQ9NVV0 291 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT11O96014 354 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLE4Q04727 773 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRN1LQ496H8 165 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAZF1Q86VZ6 243 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT4Q9H2B2 425 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB108AA8MXU0 73 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAX7P23759 505 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEX5Q5H9J7 111 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX18Q96RF0 628 aa28.96■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTAG2O75638 210 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP8Q8N3A8 854 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4K13Q8NH42 304 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSMAFQ92636 917 aa28.95■■■□□ 2.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIAH2O43255 324 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 LEG1Q6P5S2 330 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PQLC1Q8N2U9 271 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A24Q8N4F4 322 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4Q3Q8NH05 313 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMNAT3Q96T66 252 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSBPL10Q9BXB5 764 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF1Q9NS23 344 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT84Q9NSB2 600 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAC3D1A6NKF1 404 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8G3PP0DMU2 310 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRF1P14222 555 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU1F1P28069 291 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR1H2P55055 460 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM4DQ6B0I6 523 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52E2Q8NGJ4 325 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPAP1Q9NZP6 1156 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGRN1O60291 552 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FARS2O95363 451 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RENP00797 406 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRGP04196 525 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXW10Q5XX13 1052 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC27A4Q6P1M0 643 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDR9C7Q8NEX9 313 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3IP1Q96FE7 263 aa28.93■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTLA4P16410 223 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPR2P20594 1047 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGGHGQ32M88 737 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM200AQ86VY9 491 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPPR2Q96GM1 343 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUAK2Q9H093 628 aa28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A7O60669 478 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRABP1P29762 137 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPZA2P47755 286 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIPRP48546 466 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBA1BP68363 451 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBA4AP68366 448 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R2BQ00005 443 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBA1AQ71U36 451 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIAEQ9HAT2 523 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA1DQ01668 2161 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDAP32320 146 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETFDHQ16134 617 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNM1P34Q6PK57 102 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCF1Q8N6M8 205 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPEPL1Q8NDH3 523 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CIB1Q99828 191 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENOPH1Q9UHY7 261 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL21Q9UJP4 597 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA12Q86UK0 2595 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFBP5P24593 272 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRK5P34947 590 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF83P51522 516 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESRRGP62508 458 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCMAPQ5T1S8 102 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms