RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 SLC2A5P22732 501 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 POU1F1P28069 291 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 EGR3Q06889 387 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PMPCAQ10713 525 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IKZF1Q13422 519 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TSC22D1Q15714 1073 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 HIST3H3Q16695 136 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CARD17Q5XLA6 110 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 FJX1Q86VR8 437 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00471Q8N535 108 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SYT14Q8NB59 555 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TFAP2CQ92754 450 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PTP4A1Q93096 173 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC120Q96HB5 630 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ADI1Q9BV57 179 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IFT27Q9BW83 186 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 NOX3Q9HBY0 568 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 INIPQ9NRY2 104 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RNF6Q9Y252 685 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RASD1Q9Y272 281 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CADP27708 2225 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 VPS13CQ709C8 3753 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 AHRRA9YTQ3 701 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PRR32B1ATL7 298 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ARPC3O15145 178 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC16A6O15403 523 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RCBTB2O95199 551 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MPZL1O95297 269 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IL18BPO95998 194 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ITGA5P08648 1049 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 GSTM3P21266 225 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SDHAP31040 664 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PYCR1P32322 319 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 GGT2P36268 569 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ACVR1BP36896 505 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 VHLP40337 213 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ECI1P42126 302 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RPS6KA3P51812 740 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ISL1P61371 349 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 COX10Q12887 443 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PDK3Q15120 406 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SNCBQ16143 134 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF691Q5VV52 312 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RRM2BQ7LG56 351 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 UEVLDQ8IX04 471 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 OR6V1Q8N148 313 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM54Q969K7 222 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM45BQ96B21 275 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MUS81Q96NY9 551 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SYT4Q9H2B2 425 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ASB6Q9NWX5 421 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PTPN13Q12923 2485 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms