RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RBKS	Q9H477	322 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		2.28	□□□□□ -2.04
AKAP13-223	ENST00000560957	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EVC2	Q86UK5	1308 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GWB2	263 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GLTPD2	A6NH11	291 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	USP27X	A6NNY8	438 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LYRM9	A8MSI8	78 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SULT2B1	O00204	365 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR171	O14626	319 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC31A1	O15431	190 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SGCE	O43556	437 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CYTH3	O43739	400 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EED	O75530	441 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AQP8	O94778	261 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ERLIN2	O94905	339 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LALBA	P00709	142 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHG1	P01857	330 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GP1BA	P07359	652 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FCGR3A	P08637	254 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT2	P09544	360 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CTXN2	P0C2S0	81 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A6	P0DMU7	189 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A5	P0DMU8	189 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A7	P0DMV0	189 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MGMT	P16455	207 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TBP	P20226	339 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT1	P21579	422 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNB4	P30926	498 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DCT	P40126	519 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN2C	P42773	168 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR8	P51685	355 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CEBPG	P53567	150 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CRISP1	P54107	249 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT2B15	P54855	530 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V0D1	P61421	351 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	VBP1	P61758	197 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35B1	P78383	322 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ST3GAL3	Q11203	375 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC119	Q13432	240 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF876P	Q49A33	203 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	REP15	Q6BDI9	236 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	APOOL	Q6UXV4	268 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAP1	Q75T13	922 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CARM1	Q86X55	608 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PDIK1L	Q8N165	341 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T11	Q8NH01	316 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMG2	Q969U7	264 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	S100PBP	Q96BU1	408 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUB2	Q96DC9	234 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HBEGF	Q99075	208 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMB7	Q99436	277 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SORT1	Q99523	831 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MCHR1	Q99705	422 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CWH43	Q9H720	699 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf109	Q9NX04	203 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IL37	Q9NZH6	218 aa		2.27	□□□□□ -2.05

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