RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 DEFB134Q4QY38 66 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CCDC58Q4VC31 144 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ESCO2Q56NI9 601 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 FAM78AQ5JUQ0 283 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 EOGTQ5NDL2 527 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 COMMD7Q86VX2 200 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 OR8H3Q8N146 312 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TEX19Q8NA77 164 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF527Q8NB42 609 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 OR7G2Q8NG99 324 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 OR2T27Q8NH04 317 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 RSC1A1Q92681 617 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 FGF11Q92914 225 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 GIMAP5Q96F15 307 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SLC35A4Q96G79 324 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SCMH1Q96GD3 660 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 RADILQ96JH8 1075 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 GPR137Q96N19 417 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF681Q96N22 645 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SDF2Q99470 211 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SOSTQ9BQB4 213 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 APOOQ9BUR5 198 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 EDEM2Q9BV94 578 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 MED20Q9H944 212 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 Q9N2J8 555 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 GDE1Q9NZC3 331 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SPATA2Q9UM82 520 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 DAPP1Q9UN19 280 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SCML1Q9UN30 329 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ETV7Q9Y603 341 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.99□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 A0A0J9YY10 115 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 A0A1B0GUH1 482 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00862A6NCI5 91 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 WIPF3A6NGB9 483 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 HSPB2A8KAH6 182 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 C4orf51C9J302 202 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SMLR1H3BR10 107 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 GABARAPH6UMI1 98 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 J3QRE1 110 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 L7N2F9 121 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 CDC42EP2O14613 210 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PHYHO14832 338 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 FABP7O15540 132 aa3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ATXN3-241ENST00000556374 SULT1B1O43704 296 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms