RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.17□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.17□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 GLTPQ9NZD2 209 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.263e-12■■■■□ 19.3
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SENP1-210ENST00000552189 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 TBX19O60806 448 aa7.16□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 PITPNAQ00169 270 aa7.16□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 COL19A1Q14993 1142 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 OTPQ5XKR4 325 aa7.16□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 HSPB6O14558 160 aa7.15□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 GSTT2BP0CG30 244 aa7.15□□□□□ -1.26
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SENP1-210ENST00000552189 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 ZNF721Q8TF20 911 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 ZNF799Q96GE5 643 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.15□□□□□ -1.26
SENP1-210ENST00000552189 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.15□□□□□ -1.26
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