RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	OXGR1	Q96P68	337 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PANX2	Q96RD6	677 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNA7	Q96RP8	456 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLITRK2	Q9H156	845 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLMP	Q9H6B4	373 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5M	Q9NPB1	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NANS	Q9NR45	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRB	P23467	1997 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP13	Q12802	2813 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HIP1	O00291	1037 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CALM1	P0DP23	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CALM2	P0DP24	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CALM3	P0DP25	149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA8	P13928	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PGAM2	P15259	253 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KITLG	P21583	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNE1	P24864	410 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DDOST	P39656	456 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC11A1	P49279	550 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF6	P49848	677 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ASAH1	Q13510	395 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FCN2	Q15485	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MICB	Q29980	383 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RASL10A	Q92737	203 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SMARCD2	Q92925	531 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NUS1	Q96E22	293 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SERAC1	Q96JX3	654 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMB7	Q99436	277 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK6	Q9HC98	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CUTC	Q9NTM9	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	BFAR	Q9NZS9	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIP11	Q15643	1979 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KALRN	O60229	2985 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	VWA8	A3KMH1	1905 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH10	P35580	1976 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A8MXQ7	604 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ERLIN2	O94905	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLITRK3	O94933	977 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM50A	O95807	157 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		P04436	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	STS	P08842	583 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF224	P0DH78	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MCF2	P10911	925 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLL1	P15814	213 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	VDAC1	P21796	283 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GCK	P35557	465 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FDFT1	P37268	417 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	VEGFC	P49767	419 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH6	P55285	790 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	BID	P55957	195 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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