RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543882.5

TM7SF3-215, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 5

Gene TM7SF3, Length 762 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-215ENST00000543882 ERVK-25P63136 954 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 HGFACQ04756 655 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 DGCR6Q14129 220 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 LCN8Q6JVE9 175 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF627Q7L945 461 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SSX8Q7RTT4 187 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 DTX2Q86UW9 622 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SKA3Q8IX90 412 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF519Q8TB69 540 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RASD2Q96D21 266 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 Q96MF0 132 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SH3GL3Q99963 347 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 GSX2Q9BZM3 304 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 DLL4Q9NR61 685 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 VNN3Q9NY84 501 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ITPR3Q14573 2671 aa6.8□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TRIM64BA6NI03 449 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 GADD45GO95257 159 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 IGHV4-39P01824 125 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CD99P14209 185 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TTKP33981 857 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 GIPRP48546 466 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 FABP6P51161 128 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ATP5J2P56134 94 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CD47Q08722 323 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RAB39AQ14964 217 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ETFDHQ16134 617 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 MSMPQ1L6U9 139 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 GSG1Q2KHT4 349 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SPATS1Q496A3 300 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZBED5Q49AG3 693 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 MESTQ5EB52 335 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 C10orf128Q5T292 105 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 OTPQ5XKR4 325 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 VHLLQ6RSH7 139 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 RRM2BQ7LG56 351 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 FAM122BQ7Z309 247 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 DHFR2Q86XF0 187 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 MUC15Q8N387 334 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 LRRC18Q8N456 261 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 NSMAFQ92636 917 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 NABP1Q96AH0 204 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 Q96M85 177 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SMR3AQ99954 134 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 THTPAQ9BU02 230 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 PLCE1Q9P212 2302 aa6.79□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ARID1AO14497 2285 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 UNC119BA6NIH7 251 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ACOT8O14734 319 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 ARHGEF9O43307 516 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 OR10H3O60404 316 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 PTP4A3O75365 173 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 LY6HO94772 140 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 PPP1R3DO95685 299 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 CRYAAP02489 173 aa6.78□□□□□ -1.32
TM7SF3-215ENST00000543882 SCG5P05408 212 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms