RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 LRP11Q86VZ4 500 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CDK20Q8IZL9 346 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 REG4Q9BYZ8 158 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PPL8 197 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 TSPAN19P0C672 248 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM157BP0CG42 384 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP6V1B2P21281 511 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 DAP3P51398 398 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ERVS71-1P61550 626 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ETFDHQ16134 617 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 RRM2BQ7LG56 351 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 RASD2Q96D21 266 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 Q96M85 177 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SEPHS2Q99611 448 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 GPA33Q99795 319 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SYT3Q9BQG1 590 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 TPK1Q9H3S4 243 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 RERGLQ9H628 205 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NDUFAB1O14561 156 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SCG5P05408 212 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 HSD17B1P14061 328 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF84P51523 738 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CHRNB3Q05901 458 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 HIST3H3Q16695 136 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 C16orf89Q6UX73 402 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 LIPHQ8WWY8 451 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 PYURFQ96I23 114 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NSL1Q96IY1 281 aa9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NF1P21359 2839 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM129A0AVI4 362 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 INAFM1C9JVW0 142 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 UBL3O95164 117 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 GPANK1O95872 356 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 T-ENOLP0DO92 83 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 LYNX1P0DP58 116 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NPR2P20594 1047 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 CCNOP22674 350 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 RIPPLY3P57055 190 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZBED5Q49AG3 693 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF627Q7L945 461 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF519Q8TB69 540 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NABP1Q96AH0 204 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 EMC7Q9NPA0 242 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-209ENST00000533342 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 SOCS2O14508 198 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM107AO95990 144 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 SEMG1P04279 462 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 HEXAP06865 529 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 ADRA2AP08913 450 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF35P13682 527 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 RHCEP18577 417 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 NR4A1P22736 598 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 LAP3P28838 519 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 RRM2P31350 389 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 ALDH3B1P43353 468 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 OMPP47874 163 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 FXYD6P3P58550 94 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-209ENST00000533342 KRT72Q14CN4 511 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms