RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PRSS37A4D1T9 235 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SHISA9B4DS77 424 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CIB2O75838 187 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TXNDC12O95881 172 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CELA3BP08861 270 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CBR1P16152 277 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PRKACGP22612 351 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PTAFRP25105 342 aa7.56□□□□□ -1.2
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UBASH3B-205ENST00000529998 SLC6A6P31641 620 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CDAP32320 146 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CAPZA2P47755 286 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF84P51523 738 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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UBASH3B-205ENST00000529998 ETFDHQ16134 617 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 THEM4Q5T1C6 240 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.56□□□□□ -1.2
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UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CDH24Q86UP0 819 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MDP1Q86V88 176 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF75AQ96N20 296 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RBP7Q96R05 134 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IFT27Q9BW83 186 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IL20Q9NYY1 176 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 AP4S1Q9Y587 144 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 BHLHE40O14503 412 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 XKRYO14609 159 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HS3ST1O14792 307 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ARPC3O15145 178 aa7.55□□□□□ -1.2
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UBASH3B-205ENST00000529998 SOX14O95416 240 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IGKV3-15P01624 115 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IGLV1-44P01699 117 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SCG5P05408 212 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CECR9P0C854 216 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CD79AP11912 226 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CTLA4P16410 223 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RPS6KA3P51812 740 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ACTR3P61158 418 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RAB1AP62820 205 aa7.55□□□□□ -1.2
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UBASH3B-205ENST00000529998 GK3PQ14409 553 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SGCAQ16586 387 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 LRRC18Q8N456 261 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OR4K13Q8NH42 304 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FNDC8Q8TC99 324 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NABP1Q96AH0 204 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SYT4Q9H2B2 425 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SIAEQ9HAT2 523 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MOKQ9UQ07 419 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.55□□□□□ -1.2
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