RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 F8WDY8 70 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 B4GALT2O60909 372 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 NEBLO76041 1014 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 TM7SF2O76062 418 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CTDNEP1O95476 244 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OPN1MWP04001 364 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RHOXF2BP0C7M4 288 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 NPIPA8P0DM63 369 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CALCBP10092 127 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CYBAP13498 195 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 HPGDP15428 266 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 GPM6AP51674 278 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 REG3AQ06141 175 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SMARCB1Q12824 385 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA0087Q14695 138 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A52Q3SY17 297 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 C5orf47Q569G3 176 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 FAM71F2Q6NXP2 309 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CLDN19Q8N6F1 224 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 Q8N976 141 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 UBALD1Q8TB05 177 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SPIN2AQ99865 258 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 EDEM2Q9BV94 578 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ACTR6Q9GZN1 396 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 POPDC2Q9HBU9 364 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 QPCTLQ9NXS2 382 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 NPIPA1Q9UND3 350 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 COPS3Q9UNS2 423 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF292O60281 2723 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CACNA1BQ00975 2339 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 TPRP12270 2363 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1W2PNV4 684 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZSCAN12O43309 604 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CD5LO43866 347 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 COX5AP20674 150 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 UBE2AP49459 152 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RPS14P62263 151 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 HSDL2Q6YN16 418 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MOB3BQ86TA1 216 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CLEC4FQ8N1N0 589 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ARL10Q8N8L6 244 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CATSPER1Q8NEC5 780 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OR4F15Q8NGB8 312 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 BMFQ96LC9 184 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 C12orf42Q96LP6 360 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MEAF6Q9HAF1 191 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 IL36GQ9NZH8 169 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 EML5Q05BV3 1969 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa2.26□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MYH11P35749 1972 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 VWA8A3KMH1 1905 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZBED9Q6R2W3 1325 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 OBSL1O75147 1896 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 A0A087WZY1 265 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0U1RQS6 177 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 B4GALT5O43286 388 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 PRPSAP2O60256 369 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ENTPD5O75356 428 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ADCY5O95622 1261 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CNR1P21554 472 aa2.25□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MICBQ29980 383 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms