RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CT45A8P0DMV1 189 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CT45A9P0DMV2 189 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PAX1P15863 534 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DCTP40126 519 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP3R1P63098 170 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LCN10Q6JVE6 187 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PXT1Q8NFP0 134 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T29Q8NH02 315 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LPAR4Q99677 370 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PITX2Q99697 317 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SOSTQ9BQB4 213 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT9Q9BW91 350 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PADI1Q9ULC6 663 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LAMA1P25391 3075 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AGRPO00253 132 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ICOSLGO75144 302 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP8O94778 261 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP3CBP16298 524 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NPR2P20594 1047 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FOLR3P41439 243 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 VLDLRP98155 873 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 P2RY14Q15391 338 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA1AQ53H76 456 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N402 240 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NUBPLQ8TB37 319 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 THAP6Q8TBB0 222 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DOK4Q8TEW6 326 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AP3S1Q92572 193 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 S100PBPQ96BU1 408 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGDIGQ99819 225 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NANSQ9NR45 359 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CBLCQ9ULV8 474 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SDK2Q58EX2 2172 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C21orf140B9A014 251 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LDLRAD4O15165 306 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PEPDP12955 493 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC6A1P30531 599 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SDC2P34741 201 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DIO1P49895 249 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RAG2P55895 527 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PEA15Q15121 130 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF141Q15928 474 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DECR1Q16698 335 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.56□□□□□ -1.36
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