RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED5	Q49AG3	693 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG10	Q5BKT4	473 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6X1	Q8NH79	312 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	CA10	Q9NS85	328 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		15.02	■□□□□ -0
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF223	E7ERA6	249 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFS8	O00217	210 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2C1	P13056	603 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DOB	P13765	273 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MAK	P20794	623 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINF1	P36955	418 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP2	P41181	271 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR4	P46093	362 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGDIA	P52565	204 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGA2	P52926	109 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	BID	P55957	195 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS3BP	Q08380	585 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LAPTM4A	Q15012	233 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NRN1L	Q496H8	165 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51A7	Q8NH64	312 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF566	Q969W8	418 aa		15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CR1	P17927	2039 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC119B	A6NIH7	251 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFS7	O75251	213 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNB2	O95067	398 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	F13B	P05160	661 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CECR9	P0C854	216 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK1A1	P48729	337 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CLRN1	P58418	232 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK2D	Q13557	499 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MST1L	Q2TV78	715 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD17	Q5XLA6	110 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ASRGL1	Q7L266	308 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC15	Q96J42	360 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	EMC6	Q9BV81	110 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PLK3	Q9H4B4	646 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MED29	Q9NX70	200 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		15	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A096LPE4	126 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPZ6	126 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CD5L	O43866	347 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX4	O60224	188 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHG1	P01857	330 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN19	P0C672	248 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	OMP	P47874	163 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	EVX1	P49640	407 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PPOX	P50336	477 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CTXN1	P60606	82 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC23B	Q15437	767 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC8	Q8TC99	324 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM54	Q969K7	222 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP7	Q9Y680	259 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A096LNT2	108 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NIZ1	184 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R3G1	203 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP6	O75344	327 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	E2F6	O75461	281 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB2	O95178	105 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP1B	P61224	184 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP1A	P62834	184 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ADIPOQ	Q15848	244 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM168A	Q92567	244 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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