RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 CCR9P51686 369 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR10A3P58181 314 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR12D2P58182 307 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SIRPAP78324 504 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 HSPB2Q16082 182 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GSG1Q2KHT4 349 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC157Q569K6 752 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CLLU1Q5K131 121 aa8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 PRR22Q8IZ63 422 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF527Q8NB42 609 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB124Q8NES8 71 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR5J2Q8NH18 312 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CT55Q8WUE5 264 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SGTBQ96EQ0 304 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CITED4Q96RK1 184 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 ADAM19Q9H013 955 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MMP25Q9NPA2 562 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MYOTQ9UBF9 498 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TCFL5Q9UL49 500 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PRG6 482 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.67□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR6V1Q8N148 313 aa8.67□□□□□ -1.02
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POLR1A-208ENST00000486964 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GRHL3Q8TE85 626 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ASB13Q8WXK3 278 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 NSMAFQ92636 917 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf49Q96BT1 292 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ARSGQ96EG1 525 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PELI1Q96FA3 418 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.67□□□□□ -1.02
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