RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PRQ8 180 aa11.24□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 B9A039 149 aa11.24□□□□□ -0.61
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HPS1-211ENST00000478087 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.22□□□□□ -0.61
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HPS1-211ENST00000478087 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.22□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.22□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.22□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.22□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.22□□□□□ -0.61
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