RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473380.1

MSL3-211, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 433 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-211ENST00000473380 SERPINA11Q86U17 422 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TMEM25Q86YD3 366 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 VRK3Q8IV63 474 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 MTURNQ8N3F0 131 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RPEQ96AT9 228 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 FAF2Q96CS3 445 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ZNF75AQ96N20 296 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 UHRF2Q96PU4 802 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TIPINQ9BVW5 301 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 LHPPQ9H008 270 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CPVLQ9H3G5 476 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 IL36GQ9NZH8 169 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RAB26Q9ULW5 256 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 FZD1Q9UP38 647 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TFR2Q9UP52 801 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RLFQ13129 1914 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.13□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 A0A1B0GTW7 788 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 A0A1W2PR80 420 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CXorf65A6NEN9 183 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 F5H6K3 240 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 PLPP3O14495 311 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TNFSF11O14788 317 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SPINT2O43291 252 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 UGT1A9O60656 530 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 UGT2B17O75795 530 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 KRT33AO76009 404 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CALB1P05937 261 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CRHP06850 196 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RHOCP08134 193 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TFPTP0C1Z6 253 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 HOXB2P14652 356 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 MYOGP15173 224 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 LMO1P25800 156 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 MPIP34949 423 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SFTPDP35247 375 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TIMP3P35625 211 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ARR3P36575 388 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 GNPDA1P46926 289 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CSNK1A1P48729 337 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RASSF2P50749 326 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 VAMP7P51809 220 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 PGGT1BP53609 377 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR2B8PP59922 312 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CDKL1Q00532 357 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 C2orf80Q0P641 193 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TRAF3Q13114 568 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RAB31Q13636 194 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RPEL1Q2QD12 228 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 EMBQ6PCB8 327 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SPESP1Q6UW49 350 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 LRRC31Q6UY01 552 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 ASRGL1Q7L266 308 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 MRGPREQ86SM8 312 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 HPS6Q86YV9 775 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 EID3Q8N140 333 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 BEST3Q8N1M1 668 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 TERB1Q8NA31 727 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.12□□□□□ -1.75
MSL3-211ENST00000473380 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.12□□□□□ -1.75
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